Viele Spieler hatten insgeheim auf die Ankündigung eines neuen Metroid Prime für die Wii U auf der diesjährigen E3 gehofft.  Leider wurden diese Erwartungen nicht erfüllt. Stattdessen wurde Metroid Prime: Federation Force angekündigt.  Ein Spiel welches, nach der Meinung der meisten Fans, so gar nichts mit Metroid zu tun hat.
Dies spiegelt sich zumindest in den Kommentaren und Bewertung in diversen Videos wieder. Es gibt mittlerweile sogar eine Petition die verlangt die Produktion des Spiels einzustellen.
Kensuke Tanabe (Produzent der Metroid Prime Serie) hingegen ließ verlauten, dass er Ideen für ein weiteres Spiel habe, dies aber mindestens 3 Jahre Entwicklungsdauer hätte. Ein Release auf der Wii U ist somit eigentlich ausgeschlossen.