Bald wird Flipnote-3D erscheinen, daher stellt der DSi-Service seinen Dienst ein. DSi-Besitzer können aber ihre Daten auf ein neues Konto übertragen:

"Vielen Dank, dass Sie Flipnote Hatena und die Nintendo DSiWare-Anwendungssoftware Flipnote Studio genutzt haben. Bitte beachten Sie, dass der von Hatena Co., Ltd. betriebene Flipnote Hatena-Service zum 31. Mai 2013 eingestellt wird.

Dennoch können Sie Ihre hochgeladenen Flipnotes im neuen Online-Service Flipnote Studio 3D, der von Nintendo Co., Ltd. betrieben wird (voraussichtlicher Erscheinungstermin: Sommer 2013), immer noch teilen.

Hinweis: Falls Sie nicht bis zum 31. Mai 2013 widersprechen, werden alle Flipnotes (einschließlich anhängender Daten, wie Autoren-ID, Flipnote-ID und dem Erstellungsdatum) auf Flipnote Studio 3D übertragen. Nachdem Sie sich unter http://flipnote.hatena.com/guide/movie_transfer eingeloggt haben, erhalten Sie weitere Informationen zum Transfer und können Ihre Auswahl treffen.

Hinweis: Falls Sie sich bis zum 31. Mai 2013 nicht anders entscheiden, werden alle Flipnotes automatisch ins Nintendo DSi-Archiv übertragen."