Pikmin 3 soll sich wieder mehr an dem ersten Gamecube Ableger orientieren, so Shigeru Miyamoto in der aktuellen Game Master Ausgabe. In Pikmin 2 habe man einige Veränderungen vorgenommen, weil der erste Teil einigen Spielern besonders wegen des Zeitlimits zu stressig bzw. schwierig war. Doch damit konnte sich Miyamoto nicht zu 100% anfreunden, sodass er zu Beginn der Arbeiten an Pikmin 3 mit allen wichtigen Leuten gesprochen hat, die am zweiten Teil beteiligt waren. Miyamota sagte ihnen, das er es für sehr wichtig halte wieder zu den Wurzeln von Pikmin 1 zurückzukehren. Und so musste er nur noch alle davon Überzeugen, wieder in die ursprüngliche Richtung zu gehen.