Die Automaten Version von F-Zero wird einige Unterschiede zu der GCN-Version aufweisen. So wird es einen geheimen Fahrer geben, der sich auf dem Würfel wohl niemals blicken lassen wird. Durch Vernetzung der Automaten können sich bis zu vier Spielern heiße Duelle in der Zukunft liefern. Außerdem wird man im Time Attack-Modus einen Zahlencode bekommen, welchen man via PC später im Internet eingeben kann, um sich in eine virtuelle Highscore-Liste einzutragen.