Eine Quelle nahe Rare hat IGNcube mitgeteilt, dass sich Perfect Dark Zero nur sehr langsam weiterentwickelt und möglicherweise nichtmal vor 2004 erscheinen wird. Als Gründe dafür werden interne Teamprobleme bei Rare sowie eine Disorganisation zwischen Rare und Nintendo angegeben. Rare wollte zu der Geschichte noch kein Kommentar abgeben.